Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HELBQ8NG08 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms