Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM58Q8NG06 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms