Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms