Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BBOF1Q8ND07 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBOF1Q8ND07 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms