Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HJURPQ8NCD3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms