Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAJ2

C9orf106, Putative uncharacterized protein C9orf106, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106Q8NAJ2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf106Q8NAJ2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf106Q8NAJ2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf106Q8NAJ2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf106Q8NAJ2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf106Q8NAJ2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf106Q8NAJ2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf106Q8NAJ2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf106Q8NAJ2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf106Q8NAJ2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf106Q8NAJ2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf106Q8NAJ2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf106Q8NAJ2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf106Q8NAJ2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf106Q8NAJ2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf106Q8NAJ2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf106Q8NAJ2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf106Q8NAJ2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf106Q8NAJ2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
C9orf106Q8NAJ2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
C9orf106Q8NAJ2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf106Q8NAJ2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms