Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FSIP1Q8NA03 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSIP1Q8NA03 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms