Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZIC4Q8N9L1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC4Q8N9L1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms