Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7H5

PAF1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAF1Q8N7H5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAF1Q8N7H5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAF1Q8N7H5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms