Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MSL3Q8N5Y2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms