Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms