Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL2Q8N4E4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms