Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms