Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D3Q8IZS8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms