Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOT2Q8IXI1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms