Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVV2

LOXHD1, Lipoxygenase homology domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXHD1Q8IVV2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LOXHD1Q8IVV2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LOXHD1Q8IVV2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms