Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR49Q8IV35 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms