Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF13Q86YI8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF13Q86YI8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF13Q86YI8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms