Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y38

XYLT1, Xylosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XYLT1Q86Y38 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
XYLT1Q86Y38 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XYLT1Q86Y38 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XYLT1Q86Y38 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XYLT1Q86Y38 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XYLT1Q86Y38 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
XYLT1Q86Y38 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
XYLT1Q86Y38 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XYLT1Q86Y38 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XYLT1Q86Y38 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XYLT1Q86Y38 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XYLT1Q86Y38 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XYLT1Q86Y38 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XYLT1Q86Y38 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XYLT1Q86Y38 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XYLT1Q86Y38 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XYLT1Q86Y38 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XYLT1Q86Y38 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XYLT1Q86Y38 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XYLT1Q86Y38 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XYLT1Q86Y38 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XYLT1Q86Y38 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XYLT1Q86Y38 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XYLT1Q86Y38 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XYLT1Q86Y38 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XYLT1Q86Y38 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XYLT1Q86Y38 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XYLT1Q86Y38 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XYLT1Q86Y38 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XYLT1Q86Y38 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XYLT1Q86Y38 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XYLT1Q86Y38 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms