Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS37DQ86XT2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS37DQ86XT2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms