Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC84Q86UT8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms