Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC6BQ86SZ2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC6BQ86SZ2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC6BQ86SZ2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC6BQ86SZ2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC6BQ86SZ2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC6BQ86SZ2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC6BQ86SZ2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC6BQ86SZ2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC6BQ86SZ2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC6BQ86SZ2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC6BQ86SZ2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms