Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ATG9AQ7Z3C6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG9AQ7Z3C6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG9AQ7Z3C6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG9AQ7Z3C6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG9AQ7Z3C6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG9AQ7Z3C6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG9AQ7Z3C6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG9AQ7Z3C6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG9AQ7Z3C6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG9AQ7Z3C6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG9AQ7Z3C6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG9AQ7Z3C6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG9AQ7Z3C6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG9AQ7Z3C6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG9AQ7Z3C6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG9AQ7Z3C6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG9AQ7Z3C6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG9AQ7Z3C6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG9AQ7Z3C6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG9AQ7Z3C6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG9AQ7Z3C6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG9AQ7Z3C6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG9AQ7Z3C6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG9AQ7Z3C6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1069.6 ms