Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDXQ7Z353 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDXQ7Z353 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms