Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTF1AQ7RTS3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms