Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q71RC1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q71RC1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q71RC1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q71RC1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Q71RC1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q71RC1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q71RC1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q71RC1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q71RC1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q71RC1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q71RC1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q71RC1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q71RC1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q71RC1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q71RC1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q71RC1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q71RC1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q71RC1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q71RC1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q71RC1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q71RC1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q71RC1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q71RC1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q71RC1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q71RC1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q71RC1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q71RC1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q71RC1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q71RC1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q71RC1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q71RC1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q71RC1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q71RC1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q71RC1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q71RC1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q71RC1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q71RC1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q71RC1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q71RC1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q71RC1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q71RC1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q71RC1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Q71RC1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q71RC1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q71RC1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q71RC1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q71RC1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q71RC1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Q71RC1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q71RC1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Q71RC1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q71RC1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Q71RC1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q71RC1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q71RC1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q71RC1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q71RC1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q71RC1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q71RC1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q71RC1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q71RC1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q71RC1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q71RC1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q71RC1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q71RC1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q71RC1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q71RC1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q71RC1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q71RC1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q71RC1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q71RC1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q71RC1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q71RC1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q71RC1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q71RC1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q71RC1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q71RC1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q71RC1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q71RC1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q71RC1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q71RC1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q71RC1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q71RC1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q71RC1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q71RC1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q71RC1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q71RC1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q71RC1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q71RC1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q71RC1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q71RC1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q71RC1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Q71RC1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q71RC1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q71RC1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q71RC1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q71RC1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q71RC1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q71RC1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms