Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RBM43Q6ZSC3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms