Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC129Q6ZRS4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms