Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SRCAPQ6ZRS2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRCAPQ6ZRS2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRCAPQ6ZRS2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms