Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFXL1Q6ZNB6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms