Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCL17Q6UXB2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCL17Q6UXB2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCL17Q6UXB2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCL17Q6UXB2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCL17Q6UXB2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCL17Q6UXB2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL17Q6UXB2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL17Q6UXB2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL17Q6UXB2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL17Q6UXB2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL17Q6UXB2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL17Q6UXB2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL17Q6UXB2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL17Q6UXB2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL17Q6UXB2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL17Q6UXB2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL17Q6UXB2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL17Q6UXB2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL17Q6UXB2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL17Q6UXB2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL17Q6UXB2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL17Q6UXB2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL17Q6UXB2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL17Q6UXB2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL17Q6UXB2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL17Q6UXB2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms