Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms