Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUX4L9Q6RFH8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms