Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAF7Q6Q0C0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms