Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBA3EQ6PEY2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBA3EQ6PEY2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBA3EQ6PEY2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBA3EQ6PEY2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBA3EQ6PEY2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBA3EQ6PEY2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBA3EQ6PEY2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA3EQ6PEY2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA3EQ6PEY2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA3EQ6PEY2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA3EQ6PEY2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA3EQ6PEY2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA3EQ6PEY2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA3EQ6PEY2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA3EQ6PEY2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBA3EQ6PEY2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms