Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFCAB12Q6NXP0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms