Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms