Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMBOX1Q6NT76 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMBOX1Q6NT76 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms