Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX8Q68G74 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms