Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WSCD1Q658N2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms