Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZKSCAN2Q63HK3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ZKSCAN2Q63HK3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms