Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms