Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
CARMIL1Q5VZK9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
CARMIL1Q5VZK9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CARMIL1Q5VZK9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms