Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms