Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms