Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms