Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms