Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF58

IFFO2, Intermediate filament family orphan 2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO2Q5TF58 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFFO2Q5TF58 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFFO2Q5TF58 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms