Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC18Q5T9S5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC18Q5T9S5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC18Q5T9S5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms