Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms